无论你把水晶作为饰物、摆设或使用水晶的力量，均需要先清洗水晶，然后才可以有效地运用。因为水晶从开采那一刻直到你手中，途中经过不同人接触，水晶会将他们的思想、运气及身体状况完全记录下来。所以我们要先把所有记录清除以便输入自己的信息。这样使用水晶时，便不会受前人影响。
　　清洗可称为消磁、净化。现在让我们介绍最简单也最多朋友使用的方法。
　　★ 阳光消磁法
　　找一个风和日丽的好天气，晒得到太阳又安全不会被偷或被小孩子宠物碰到的地方(如阳台、窗边等)，将用矿泉水或过滤水洗净的水晶放置在阳光下晒，尤其正午时的阳光最好，晒上半天就可以了，此法除了净化同时还能帮晶品充电。
　　但提醒大家，若是有色的水晶，如粉晶、紫晶，最好不用阳光消磁法，因高温易改变内之分子结构，色泽容易变淡变白，就比较可惜。最适合用阳光消磁法的是白晶、黄晶、茶晶、发晶等较耐高温的晶石。
　　★ 粗盐消磁法
　　所谓粗盐就是指还未精制前的天然海盐，将海盐放在器皿中(最好避免用塑料，压克力等化工合成材质), 玻璃，瓷碗都可以，加入矿泉水或过滤过的清水，最后再放入晶石，水量盖过晶石即可或者直接盖以粗盐，二十四小时后,将水晶拿出冲洗干净；放置阳光(阴凉处)下三，四小时，让它回复生命力，这清洁原理是海盐本身有吸纳杂质，清洁的功用！可以配合阳光或月光消磁法是事半功倍，除了净化还能充电。
　　不过，此法较不适用于镶有金属环扣的水晶坠子或其它水晶饰品，因盐份会腐蚀金属及线绳，影响美观外也容易导致金属锈蚀松脱或绳线断裂，要特别小心。还有一些硬度比较低的软性宝石如方解石及有机宝石如珊瑚，琥珀等也不适用；较适用于未经琢磨的小晶石。用过的粗盐水已经充满先前浸泡水晶的负面能量，最好不要再拿来净化别的水晶，这样是会有反效果的哦！
　　★ 大自然消磁法
　　利用大自然的力量消磁，水晶很喜欢自然的力量。若出外旅行，到一些山明水秀的地方，举凡山泉，瀑布，溪流，海边，只要是不受污染的水边，就可以将水晶泡到水里面，利用大自然的力量，帮水晶净化充电。
　　★ 音乐消磁法
　　水晶是活的宝石，尤其它会有纪录声波的能力，所以可以挑选些好的音乐--温和宁静的，活泼开朗的音乐都好，或者大自然的声音，如海潮声、鸟叫声等，甚至现在有些现成的水晶音乐(用水晶杯或水晶琴等水晶制作的乐器敲击出的音乐)也可以。有宗教信仰的人当然可以选择自己的宗教音乐，如圣诗或佛号等。听个半天下来，也有消磁的作用。
　　这种方法尤其适用于不易搬动的晶石，当然超过２、３公斤以上的晶石自己便已是一座发电机，按理说应不必充电了，但听听好的音乐会让它充满正面的能量，对人还是很有帮助的。
　　★ 净香消磁法
　　就是运用香柱、香塔的熏香，让缭绕的香烟来净化水晶。别小看那袅袅如绕指柔般的青烟一缕，它的力量可是非常强大的，气味优雅的檀香或沉香，或者近年流行的芳香疗法用的各种花果香精，都有净化效果；此法与音乐消磁法也是拥有大型晶石及店家最常用的方法，因为不必搬动任何且方便有效，不会有所遗漏。
　　★ 庙宇过香法
　　依不同宗教至不同地点，佛道教徒可至各庙宇道观，将水晶带往人气鼎盛的大庙，要注意是拜“正神”的庙宇，而非拜“阴神”的庙，至那感受法力加持,及充满好的意念净化(试想那儿有多少人前往参拜,所求皆是美好的祈愿,整个空间亦徘徊着正面念力在此,这就是为什幺很多学气、练气的道上朋友喜好前往此处.感应和接收这庞大的正性能量场)。将水晶在香炉上左三圈或右三圈绕一绕，就可以完成消磁了。若是基督教或天主教徒，则可带着水晶进教堂作礼拜，唱圣诗，让水晶浸淫在虔诚神圣的气氛中，自然而然就净化了。
　　★ 晶洞晶簇消磁法
　　差不多所有水晶专家都同意的看法，便是将水晶放在水晶簇(或紫晶洞)上,让晶簇(晶洞)发出生生不息的振动能量，清除水晶噪声及为它重新充电，效果之大非言语所形容。
　　家中若拥有一个3公斤以上的大型晶洞或晶簇是最方便的了，一些水晶小饰品便可以经常“撘便车”，只要睡觉前将这些水晶小饰品往晶洞或晶簇上一放，第二天早上就已经净化好，你可以放心戴上出门，因为晶洞晶簇已经自动帮你的水晶净化充电了；不过放上去晶洞或晶簇时得小心，要轻轻的放，不要用丢的，因为水晶的硬度为7及各种天然宝石硬度各不相同，若太大力，晶体彼此摩擦碰撞，难免形成伤痕，那就太可惜了！
　　经过上述任一净化方法的执行，水晶饰品都可安心地收藏和佩戴了；还要提醒您，水晶(天然宝石)要常清洗，可保持其能量；并请切记：水晶为智能有情物，请加以善待！它会回报您更多的！